在讨论肾穿刺活体组织检查法的适应症之前，接受肾穿刺的患者应当排除顾虑。—般医生选择为肾穿刺对象的病人，多是在严格掌握和了解了病情之后，根据适应症和禁忌症的要求而决定的。在这种情况下，肾穿刺不会加重肾脏的损害。因为肾脏中大约有100多万个肾单位，而肾穿刺仅取其10～50个肾单位，是极微少的。另外，肾脏具有良好的贮备力和修复能力，一般只有40％的肾单位在进行工作。可见，尽管肾穿刺是一种创伤性的检查方法，总体来说还是安全的。
肾穿刺活体组织检查法的适应症主要有：
1、考虑为弥漫性病变，如各型肾小球肾炎、肾病综合征、全身性疾病如系统性红斑狼疮、糖尿病、结节性多动脉炎、淀粉样变性等引起的肾脏损害
2、不明原因的血尿，在排除为非肾小球源性血尿时，应进行肾穿刺活体组织检查，以明确诊断。
3、不明原因而持续的蛋白尿。经临床各项检查，考虑为肾小管--间质病变者。
4、肾功能不全者，在诊断和确定治疗方案存在困难时，尤其急性起病，怀疑为急进性肾炎时，应及早行肾穿刺活体组织检查，以确诊并有利于制定治疗方案。
5、当怀疑为慢性肾盂肾炎，但又不能排除慢性肾炎时，而且临床上又无足够证据进行鉴别诊断者。
6、肾移植后出现可疑的排斥反应，或诊为排斥反应而治疗又无效，或怀疑原有肾病又复发，应进行肾穿刺活体组织检查。
7、其它，如不明原因的高血压，病情与治疗需要应进行连续肾穿刺活体组织检查以修正诊断、修订治疗方案者。
